MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli O55:H7 str. RM12579 plasmid p12579_2

Total Repeats: 959

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017657	CAT	2	6	47	52	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504845
2	NC_017657	TC	3	6	98	103	0 %	50 %	0 %	50 %	387504845
3	NC_017657	ATG	2	6	174	179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504845
4	NC_017657	GGC	2	6	192	197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387504845
5	NC_017657	CAT	2	6	293	298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504845
6	NC_017657	AC	3	6	363	368	50 %	0 %	0 %	50 %	387504845
7	NC_017657	TGTAC	2	10	500	509	20 %	40 %	20 %	20 %	387504846
8	NC_017657	GTG	2	6	574	579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387504846
9	NC_017657	ACG	2	6	701	706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504846
10	NC_017657	GAA	2	6	724	729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387504846
11	NC_017657	GGCA	2	8	789	796	25 %	0 %	50 %	25 %	387504846
12	NC_017657	GAA	2	6	862	867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387504846
13	NC_017657	GCG	2	6	1704	1709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387504847
14	NC_017657	GAT	2	6	1800	1805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504847
15	NC_017657	CGT	2	6	1870	1875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504848
16	NC_017657	CTT	2	6	1881	1886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387504848
17	NC_017657	GAA	2	6	1895	1900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387504848
18	NC_017657	A	8	8	1899	1906	100 %	0 %	0 %	0 %	387504848
19	NC_017657	CAG	2	6	1937	1942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504848
20	NC_017657	CTGA	2	8	1944	1951	25 %	25 %	25 %	25 %	387504848
21	NC_017657	A	6	6	1956	1961	100 %	0 %	0 %	0 %	387504848
22	NC_017657	CTG	2	6	2120	2125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504848
23	NC_017657	CCG	2	6	2283	2288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387504849
24	NC_017657	GAT	2	6	2305	2310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504849
25	NC_017657	CAA	2	6	2387	2392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387504849
26	NC_017657	ATC	2	6	2398	2403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504849
27	NC_017657	TGA	2	6	2415	2420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504849
28	NC_017657	ATG	2	6	2561	2566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504849
29	NC_017657	GAT	2	6	2583	2588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504849
30	NC_017657	AAT	2	6	2635	2640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387504849
31	NC_017657	ATA	2	6	2735	2740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387504849
32	NC_017657	GAAA	2	8	2751	2758	75 %	0 %	25 %	0 %	387504849
33	NC_017657	ATTT	2	8	2783	2790	25 %	75 %	0 %	0 %	387504849
34	NC_017657	CGT	2	6	2866	2871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504849
35	NC_017657	CAA	2	6	3015	3020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387504849
36	NC_017657	CGC	2	6	3480	3485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387504850
37	NC_017657	CGT	2	6	3486	3491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504850
38	NC_017657	TGG	3	9	3517	3525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387504850
39	NC_017657	CTG	2	6	3609	3614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504850
40	NC_017657	GCC	2	6	3654	3659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387504850
41	NC_017657	TGA	2	6	3776	3781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504850
42	NC_017657	TGA	2	6	3865	3870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504850
43	NC_017657	CGG	2	6	3915	3920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387504850
44	NC_017657	CCA	2	6	3955	3960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387504850
45	NC_017657	CTG	3	9	4011	4019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504850
46	NC_017657	CTGC	2	8	4056	4063	0 %	25 %	25 %	50 %	387504850
47	NC_017657	GAA	2	6	4067	4072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387504850
48	NC_017657	AGA	2	6	4088	4093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387504850
49	NC_017657	AGC	2	6	4323	4328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504850
50	NC_017657	CTG	2	6	4329	4334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504850
51	NC_017657	GCT	2	6	4370	4375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504850
52	NC_017657	AGG	2	6	4381	4386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387504850
53	NC_017657	CAA	2	6	4429	4434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387504850
54	NC_017657	A	6	6	4452	4457	100 %	0 %	0 %	0 %	387504850
55	NC_017657	GCG	2	6	4458	4463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387504850
56	NC_017657	GCA	2	6	4663	4668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504850
57	NC_017657	CCGCT	2	10	4669	4678	0 %	20 %	20 %	60 %	387504850
58	NC_017657	TTC	2	6	4843	4848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387504851
59	NC_017657	TCTGGT	2	12	4928	4939	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	387504851
60	NC_017657	T	6	6	4998	5003	0 %	100 %	0 %	0 %	387504851
61	NC_017657	ATA	2	6	5019	5024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387504851
62	NC_017657	TGT	2	6	5055	5060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387504851
63	NC_017657	TGGCA	2	10	5258	5267	20 %	20 %	40 %	20 %	387504851
64	NC_017657	T	6	6	5307	5312	0 %	100 %	0 %	0 %	387504851
65	NC_017657	ATG	2	6	5757	5762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504852
66	NC_017657	A	6	6	5769	5774	100 %	0 %	0 %	0 %	387504852
67	NC_017657	ATT	2	6	5783	5788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387504852
68	NC_017657	CTT	2	6	5852	5857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387504852
69	NC_017657	TAA	2	6	5926	5931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387504852
70	NC_017657	CTT	2	6	5936	5941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387504852
71	NC_017657	ATC	2	6	5962	5967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504852
72	NC_017657	TC	3	6	5993	5998	0 %	50 %	0 %	50 %	387504852
73	NC_017657	ATC	2	6	6067	6072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504852
74	NC_017657	T	6	6	6086	6091	0 %	100 %	0 %	0 %	387504852
75	NC_017657	A	6	6	6094	6099	100 %	0 %	0 %	0 %	387504852
76	NC_017657	TGA	3	9	6100	6108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504852
77	NC_017657	CAA	2	6	6320	6325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387504853
78	NC_017657	CTG	2	6	6347	6352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504853
79	NC_017657	ATTT	2	8	6418	6425	25 %	75 %	0 %	0 %	387504853
80	NC_017657	T	6	6	6423	6428	0 %	100 %	0 %	0 %	387504853
81	NC_017657	AG	3	6	6495	6500	50 %	0 %	50 %	0 %	387504853
82	NC_017657	ATT	2	6	6641	6646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387504853
83	NC_017657	GAA	2	6	7187	7192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387504854
84	NC_017657	TAA	2	6	7211	7216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387504854
85	NC_017657	ATC	2	6	7226	7231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504854
86	NC_017657	CAGGG	2	10	7254	7263	20 %	0 %	60 %	20 %	387504854
87	NC_017657	GAT	2	6	7309	7314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504854
88	NC_017657	CAGA	2	8	7379	7386	50 %	0 %	25 %	25 %	387504854
89	NC_017657	GCT	2	6	7625	7630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504855
90	NC_017657	TGA	2	6	7635	7640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504855
91	NC_017657	TTC	2	6	7643	7648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387504855
92	NC_017657	GCA	2	6	7671	7676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504855
93	NC_017657	GTT	2	6	7742	7747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387504855
94	NC_017657	GTT	2	6	7754	7759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387504855
95	NC_017657	ATG	2	6	7793	7798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504855
96	NC_017657	CAT	2	6	7831	7836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504855
97	NC_017657	TATT	2	8	7842	7849	25 %	75 %	0 %	0 %	387504855
98	NC_017657	CGT	2	6	7864	7869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504855
99	NC_017657	ACCA	2	8	7945	7952	50 %	0 %	0 %	50 %	387504856
100	NC_017657	GCA	2	6	7993	7998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504856
101	NC_017657	A	6	6	8077	8082	100 %	0 %	0 %	0 %	387504856
102	NC_017657	A	6	6	8086	8091	100 %	0 %	0 %	0 %	387504856
103	NC_017657	CTG	2	6	8146	8151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504856
104	NC_017657	TTTATA	2	12	8275	8286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387504857
105	NC_017657	CT	3	6	8308	8313	0 %	50 %	0 %	50 %	387504857
106	NC_017657	CAG	2	6	8437	8442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504857
107	NC_017657	TCA	2	6	8479	8484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504857
108	NC_017657	AT	3	6	8520	8525	50 %	50 %	0 %	0 %	387504857
109	NC_017657	GAA	2	6	8566	8571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387504857
110	NC_017657	GTG	2	6	8660	8665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387504857
111	NC_017657	CTGG	2	8	8751	8758	0 %	25 %	50 %	25 %	387504857
112	NC_017657	A	6	6	8785	8790	100 %	0 %	0 %	0 %	387504857
113	NC_017657	AAT	2	6	8800	8805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387504858
114	NC_017657	T	7	7	8819	8825	0 %	100 %	0 %	0 %	387504858
115	NC_017657	GTG	2	6	8867	8872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387504858
116	NC_017657	GGT	2	6	8885	8890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387504858
117	NC_017657	CGG	2	6	9007	9012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387504858
118	NC_017657	CAA	2	6	9031	9036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387504858
119	NC_017657	GAA	2	6	9155	9160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387504858
120	NC_017657	CCGT	2	8	9219	9226	0 %	25 %	25 %	50 %	387504858
121	NC_017657	GCC	2	6	9374	9379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387504859
122	NC_017657	ATG	2	6	9410	9415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504859
123	NC_017657	CGC	2	6	9448	9453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387504859
124	NC_017657	TCGC	2	8	9460	9467	0 %	25 %	25 %	50 %	387504859
125	NC_017657	CGT	2	6	9518	9523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504859
126	NC_017657	AGG	2	6	9531	9536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387504859
127	NC_017657	CTG	2	6	9611	9616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504859
128	NC_017657	AT	3	6	9719	9724	50 %	50 %	0 %	0 %	387504859
129	NC_017657	G	6	6	9733	9738	0 %	0 %	100 %	0 %	387504859
130	NC_017657	CCA	2	6	9753	9758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387504859
131	NC_017657	TCA	2	6	9759	9764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504859
132	NC_017657	AG	3	6	9808	9813	50 %	0 %	50 %	0 %	387504859
133	NC_017657	CTGG	2	8	9934	9941	0 %	25 %	50 %	25 %	387504859
134	NC_017657	GA	3	6	10049	10054	50 %	0 %	50 %	0 %	387504859
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253	NC_017657	ATA	2	6	17919	17924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387504869
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257	NC_017657	ATA	2	6	18081	18086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387504869
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259	NC_017657	AAT	2	6	18173	18178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387504869
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261	NC_017657	ATG	2	6	18372	18377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504869
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263	NC_017657	G	6	6	18480	18485	0 %	0 %	100 %	0 %	387504870
264	NC_017657	TAA	2	6	18564	18569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387504870
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